工(gōng )藤新一是全国著名的(de )高中(zhōng )生侦(zhēn )探(tàn )，在一次追查黑(hēi )衣人犯罪团伙时不(bú )幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了(le )小孩！新一找(zhǎo )到了经(jīng )常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍(dié )武器。为了防止犯罪团伙(huǒ )对他进行报复，新一决定(dìng )隐姓埋名，暗中追查(chá )他们，希望(wàng )能得(dé )到解药。一日，新一 的女友毛(máo )利兰来到了阿(ā )笠博士的家寻找男(nán )友的下落(luò )，被小兰撞见(jiàn )的新一情急之下(xià )编造(zào )了自己名叫江(jiāng )户川柯南，随后(hòu )柯南寄居在了小兰家。小(xiǎo )兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新(xīn )一可(kě )以籍(jí )着和他一(yī )起四出办案一起追(zhuī )查(chá )黑夜(yè )人的下(xià )落。柯(kē )南在小学认识步美等小(xiǎo )学(xué )生，他们一起组织了一个(gè )少年侦探团，向罪犯宣战！