工藤新一是全国著名(míng )的高(gāo )中生(shēng )侦探，在(zài )一(yī )次追查(chá )黑衣人(rén )犯罪(zuì )团伙时不幸被团伙成员发现，击(jī )晕后喂了神奇的药水，工藤新(xīn )一(yī )变回了小孩！新(xīn )一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少(shǎo )间(jiān )谍武(wǔ )器(qì )。为(wéi )了(le )防止犯罪团伙对他进行报(bào )复，新一决定隐(yǐn )姓埋名，暗中追查他们，希望能得到(dào )解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下(xià )落，被小兰(lán )撞见(jiàn )的新一情急之(zhī )下(xià )编造了自己名叫江户川(chuān )柯南，随后柯南(nán )寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可(kě )以(yǐ )籍着和(hé )他一(yī )起四出办案(àn )一起追查(chá )黑夜人的下落(luò )。柯南在小学认识步美等(děng )小学生，他们一起组(zǔ )织了一个少年(nián )侦探团，向罪犯宣战(zhàn )！