工藤新一是全国著名的高(gāo )中生侦探(tàn )，在一次追查黑衣(yī )人犯罪团伙时不(bú )幸被团伙成(chéng )员(yuán )发(fā )现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新(xīn )一变回(huí )了(le )小孩！新一找到了经常帮助他的阿(ā )笠博士，博(bó )士为他(tā )度身打造(zào )不少间谍武器。为了防(fáng )止犯罪团(tuán )伙对(duì )他进(jìn )行报复，新(xīn )一决定隐姓埋名，暗中(zhōng )追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博(bó )士的家寻找男(nán )友(yǒu )的下落，被(bèi )小兰撞见的新一情(qíng )急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后(hòu )柯南寄居在了小兰家(jiā )。小兰的父亲毛利小五郎(láng )是一名私家侦探，新一可以籍(jí )着和他一起四出办案一起追查(chá )黑夜人的下(xià )落。柯(kē )南在小学认(rèn )识(shí )步美等小学生，他(tā )们一(yī )起组织(zhī )了一个少年侦探团，向罪犯宣战！