工藤新一是全国著(zhe )名的高(gāo )中(zhōng )生侦探，在一次追查黑衣人犯罪(zuì )团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的(de )药水，工藤新一(yī )变回了小(xiǎo )孩！新一找到了经常帮助他(tā )的(de )阿笠博士，博(bó )士(shì )为他度身(shēn )打造不少间谍武器(qì )。为(wéi )了防止犯罪(zuì )团(tuán )伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查(chá )他们，希望能得到解药(yào )。一日，新一 的女友毛利兰来到了(le )阿(ā )笠博(bó )士(shì )的家寻找男友的下落，被(bèi )小兰撞见的新一(yī )情(qíng )急(jí )之下编造了自己名叫江户川柯(kē )南，随后柯南寄居在了小兰家。小(xiǎo )兰的父亲毛(máo )利小五(wǔ )郎(láng )是一名私家(jiā )侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人(rén )的(de )下落。柯南在小学认(rèn )识步美等小学生，他(tā )们一起组织了(le )一(yī )个(gè )少年侦(zhēn )探团，向罪犯宣战！