工(gōng )藤(téng )新(xīn )一是全国(guó )著名的(de )高中生侦探，在一次(cì )追查(chá )黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一(yī )变回(huí )了小孩！新一找到了经(jīng )常帮助(zhù )他的(de )阿笠博士，博士为(wéi )他度身打(dǎ )造不少间谍武器(qì )。为(wéi )了防止犯罪团(tuán )伙对他进行报复(fù )，新一决(jué )定隐姓埋(mái )名，暗(àn )中追查他们(men )，希望能得(dé )到解药(yào )。一日，新一 的女友毛(máo )利(lì )兰来到(dào )了阿笠博士的家(jiā )寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情(qíng )急之(zhī )下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居(jū )在了小兰家。小兰的父亲毛利小五(wǔ )郎(láng )是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的(de )下落。柯南(nán )在小学(xué )认识步美等小学生，他们一起(qǐ )组(zǔ )织了一个少年侦探团(tuán )，向罪犯宣战！