工藤新(xīn )一是全国著名(míng )的高中生侦探，在一次(cì )追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药(yào )水，工藤新一(yī )变回了小孩！新一找到了经常帮助(zhù )他的阿笠博士，博士为(wéi )他度身打(dǎ )造(zào )不少间谍武(wǔ )器。为了防止(zhǐ )犯罪团伙对(duì )他(tā )进行报复(fù )，新一决(jué )定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻(xún )找男友(yǒu )的下落，被(bèi )小(xiǎo )兰撞(zhuàng )见的新一情(qíng )急之下编造了(le )自(zì )己名叫江户川柯南，随(suí )后柯南寄居在了小兰家(jiā )。小(xiǎo )兰的父亲毛(máo )利小五郎是一名私家侦(zhēn )探，新一可以籍着和他一起四(sì )出办案一(yī )起追查(chá )黑夜人的下落。柯南(nán )在小(xiǎo )学(xué )认识步美(měi )等小学生，他们(men )一起组织了一个少年侦探团，向罪(zuì )犯宣(xuān )战！