工(gōng )藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次(cì )追查黑(hēi )衣人犯罪团伙时不幸被团伙成(chéng )员(yuán )发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新(xīn )一找到(dào )了(le )经常帮助(zhù )他的阿笠博士，博士(shì )为(wéi )他度身打造不少间(jiān )谍武器。为了(le )防止犯罪团伙对他进行报复，新一决(jué )定(dìng )隐姓埋名(míng )，暗中追查他们，希望能得到解药。一日(rì )，新一 的(de )女友毛利兰来(lái )到了阿笠博士(shì )的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造(zào )了自己名叫江户川柯南(nán )，随后柯南寄居在(zài )了小(xiǎo )兰家(jiā )。小(xiǎo )兰的父亲毛利(lì )小五郎是一名私家侦(zhēn )探(tàn )，新一可以(yǐ )籍着和他一起四出办案一起(qǐ )追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步(bù )美等(děng )小学生，他们(men )一起组(zǔ )织了一个少年侦探团，向(xiàng )罪犯宣战！