工(gōng )藤新一是全国著名的高(gāo )中生(shēng )侦探(tàn )，在一次追查黑衣人(rén )犯罪团伙(huǒ )时不幸被(bèi )团伙成员发现，击晕(yūn )后喂了神奇的药(yào )水(shuǐ )，工藤新一变回(huí )了小孩！新一找到(dào )了经(jīng )常帮助(zhù )他(tā )的阿笠博士，博(bó )士为他度身打造不少间谍武器(qì )。为了(le )防止犯(fàn )罪团伙对他进行(háng )报复，新一决定隐姓(xìng )埋名，暗中(zhōng )追查他们，希望能得(dé )到解药。一日，新一(yī ) 的(de )女友毛利兰来到了阿笠博(bó )士的家寻找男友的下落，被小兰(lán )撞见的(de )新一情急之下(xià )编(biān )造了自己名叫江户川柯南，随后柯南(nán )寄居(jū )在了小兰家(jiā )。小兰的父亲毛利小五(wǔ )郎是一名私家侦探，新(xīn )一(yī )可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等(děng )小学生，他们一起组织(zhī )了一个少年侦探团，向罪犯宣战！