工藤新一是全国著名(míng )的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时(shí )不(bú )幸被团(tuán )伙(huǒ )成员发现(xiàn )，击晕后喂了神奇的(de )药水，工藤(téng )新一变回(huí )了小孩！新一找到了经常帮(bāng )助他的阿笠博士，博士为他(tā )度身打造不少间谍武器。为了防止(zhǐ )犯(fàn )罪(zuì )团伙对他(tā )进行报复，新(xīn )一决定隐姓埋(mái )名(míng )，暗(àn )中追查他们，希望能得到解药。一日(rì )，新一 的女友毛利兰来到了(le )阿笠博士的家寻找男友(yǒu )的下(xià )落，被小兰撞(zhuàng )见的新一情急(jí )之下编造了自己名叫(jiào )江户川柯南(nán )，随(suí )后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲(qīn )毛利小五郎是一名私(sī )家侦探，新一可以籍(jí )着和(hé )他(tā )一起四出办案一起追查黑夜(yè )人(rén )的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他(tā )们一(yī )起组(zǔ )织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！