工藤新一是全国(guó )著名的高中生侦探，在一次追(zhuī )查黑衣人犯罪团伙时不幸(xìng )被团伙成(chéng )员发现，击晕后喂(wèi )了神奇的药水，工藤(téng )新(xīn )一(yī )变(biàn )回了小孩！新一(yī )找(zhǎo )到(dào )了经(jīng )常帮(bāng )助他的阿笠博士，博士为他度身打造(zào )不少间谍武器。为(wéi )了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐(yǐn )姓埋名(míng )，暗(àn )中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女(nǚ )友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找(zhǎo )男友的下(xià )落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫(jiào )江户川柯南(nán )，随后柯南寄居在了小(xiǎo )兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦(zhēn )探，新一可以籍着(zhe )和他一起四出(chū )办案一起追查黑夜人的下落。柯(kē )南在(zài )小学认识步美等(děng )小学生，他们(men )一(yī )起组织了一个少年(nián )侦探团，向罪犯宣(xuān )战(zhàn )！