工藤新一是(shì )全国著名的(de )高中生侦探，在一次追(zhuī )查黑衣人犯罪团伙时不(bú )幸被团伙成员发现，击晕后喂了神(shén )奇的药水，工(gōng )藤新(xīn )一(yī )变回(huí )了小孩！新(xīn )一找到了经常帮助他的(de )阿笠博士，博士为他度(dù )身(shēn )打造不少间谍(dié )武器。为了防止犯罪团(tuán )伙对他进行报(bào )复(fù )，新一决定隐姓埋(mái )名，暗中追(zhuī )查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友(yǒu )毛利兰来到了阿笠博士的家寻(xún )找男友的下落(luò )，被小兰撞(zhuàng )见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南(nán )，随后(hòu )柯南寄(jì )居在了小兰家。小(xiǎo )兰(lán )的(de )父亲毛利小(xiǎo )五郎是一名私家侦探，新一可(kě )以(yǐ )籍着和他一起四出办案(àn )一起追查黑夜人(rén )的下落。柯南(nán )在小学(xué )认识步(bù )美等小(xiǎo )学生，他们一起组织了一个少年侦探(tàn )团，向罪(zuì )犯宣战！