工(gōng )藤新(xīn )一(yī )是全国著(zhe )名的高(gāo )中生侦探，在一次追查黑衣人犯(fàn )罪团伙时不幸被团伙(huǒ )成员发(fā )现，击晕(yūn )后喂了神奇的(de )药水，工(gōng )藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的(de )阿笠博士，博(bó )士为他度身打造不少间谍武器。为了(le )防止(zhǐ )犯罪团(tuán )伙对他进行报复，新一决定(dìng )隐(yǐn )姓埋名，暗中追查他们，希(xī )望能得到解药。一(yī )日(rì )，新一 的女友(yǒu )毛(máo )利(lì )兰来到了阿笠博士的家寻找男友的(de )下落，被小兰撞见的新一(yī )情急之下编造了自(zì )己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小(xiǎo )兰的父亲毛利小五郎(láng )是一名私家侦探，新一可以籍着和(hé )他一起四出(chū )办(bàn )案(àn )一起追(zhuī )查黑夜人的下落。柯(kē )南在小学认(rèn )识(shí )步(bù )美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！