工藤新一是全(quán )国著名的高(gāo )中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后(hòu )喂了(le )神奇(qí )的药水，工藤新一变回了(le )小孩！新一(yī )找(zhǎo )到了(le )经常帮助(zhù )他的阿笠博士，博士为(wéi )他度(dù )身打(dǎ )造(zào )不少间谍武器。为(wéi )了防止犯罪团(tuán )伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查(chá )他们，希望(wàng )能得到解药。一日，新一(yī ) 的(de )女友毛利兰(lán )来到了阿笠博士的家寻找男友的(de )下落，被(bèi )小兰撞(zhuàng )见的新一情急之下(xià )编造了自(zì )己名叫江户川柯南，随后柯(kē )南寄居在了小兰家。小(xiǎo )兰的父亲毛利小五郎(láng )是一名私家侦探，新(xīn )一可以籍着和他(tā )一起四出办案一起追查黑夜(yè )人的(de )下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一(yī )起(qǐ )组织(zhī )了一个少(shǎo )年侦探团，向罪犯宣战！