工藤新一是全(quán )国著(zhe )名的高中(zhōng )生侦探(tàn )，在(zài )一次追查黑衣(yī )人犯罪团伙时不幸(xìng )被团伙(huǒ )成员发(fā )现(xiàn )，击晕后喂了神奇的药(yào )水(shuǐ )，工藤(téng )新一变回了小孩！新一找到(dào )了经(jīng )常帮(bāng )助他的阿笠博士，博士为他度身(shēn )打(dǎ )造不少间谍武器(qì )。为了防(fáng )止(zhǐ )犯罪团伙对他进行(háng )报复，新一(yī )决定隐姓埋名，暗中追(zhuī )查他(tā )们，希望(wàng )能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被(bèi )小兰撞见的新一情急之(zhī )下编造了(le )自己名叫江户川柯南，随(suí )后柯南寄居在(zài )了小(xiǎo )兰(lán )家。小兰(lán )的父亲毛利小五郎是(shì )一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出(chū )办案一起追查(chá )黑夜(yè )人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起(qǐ )组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！