工(gōng )藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团(tuán )伙成(chéng )员发现(xiàn )，击晕后喂了神奇的药水，工(gōng )藤(téng )新(xīn )一变回了小孩(hái )！新一找到了经常帮助他的阿(ā )笠博士，博士为他度身打造不少(shǎo )间谍武(wǔ )器。为了防止犯罪团伙对他进(jìn )行报复，新一决定(dìng )隐姓埋(mái )名(míng )，暗中追查他们，希望能得(dé )到(dào )解药。一日(rì )，新一(yī ) 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友(yǒu )的下(xià )落，被小兰撞(zhuàng )见的新一情急之下(xià )编造(zào )了自己名叫(jiào )江(jiāng )户川柯南，随后(hòu )柯南寄居(jū )在了小兰家(jiā )。小兰的(de )父亲毛利小五郎是(shì )一名私家(jiā )侦探，新一可以籍着和(hé )他(tā )一起四出办案一(yī )起追查黑夜人的下落(luò )。柯南在小学认(rèn )识步美等小学生，他们一起组织了一个少(shǎo )年侦探团，向罪犯宣战！