工藤新一是全国著名的高中生侦探，在(zài )一次追(zhuī )查黑衣人(rén )犯罪团伙时不(bú )幸被团伙成员发现，击晕后喂(wèi )了神奇的药水(shuǐ )，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿(ā )笠(lì )博士(shì )，博士(shì )为他度身打造不少间谍(dié )武器。为了防止犯罪团伙对他进(jìn )行报复(fù )，新一决(jué )定(dìng )隐姓(xìng )埋名，暗中追(zhuī )查他(tā )们，希望能(néng )得到解(jiě )药。一日，新一(yī ) 的(de )女友毛(máo )利兰来到了阿(ā )笠博士的家寻找男友的下落(luò )，被小兰撞见的新一(yī )情急之下(xià )编造(zào )了自己名叫江户川(chuān )柯南，随(suí )后(hòu )柯南寄居在(zài )了小兰家。小兰的父亲毛(máo )利(lì )小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案(àn )一起追查黑夜人的下落。柯南(nán )在(zài )小(xiǎo )学认识(shí )步美等小(xiǎo )学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！