工藤新一是全(quán )国著名(míng )的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团(tuán )伙时不幸(xìng )被(bèi )团伙成(chéng )员发现，击晕后喂了神奇的药水，工(gōng )藤新一变回了(le )小(xiǎo )孩！新(xīn )一找到了经常帮助(zhù )他的阿(ā )笠博士，博士为他度身(shēn )打造不(bú )少间谍(dié )武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决(jué )定隐(yǐn )姓埋名，暗(àn )中追查他们，希(xī )望(wàng )能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来(lái )到了(le )阿笠博士的(de )家(jiā )寻找男(nán )友(yǒu )的下落，被小兰撞(zhuàng )见(jiàn )的新一情急之下(xià )编(biān )造了自己名叫江户川柯南(nán )，随后柯南寄居在了小(xiǎo )兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一(yī )可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人(rén )的下落。柯南在小学认(rèn )识步美等小学生(shēng )，他们(men )一起组织了一个少年侦探(tàn )团，向罪犯宣战(zhàn )！