工藤新一是全国著名的高中(zhōng )生侦探(tàn )，在一次追查黑衣人犯罪团伙(huǒ )时不幸被团(tuán )伙成员发现，击晕(yūn )后(hòu )喂了神奇(qí )的(de )药水，工藤(téng )新一变回(huí )了小(xiǎo )孩！新一找到了经常(cháng )帮助他的阿笠博(bó )士，博士(shì )为他(tā )度身打造不少间谍武器。为了防(fáng )止犯罪(zuì )团伙对(duì )他进行报复，新一(yī )决定隐姓埋名，暗中追查他(tā )们(men )，希望能(néng )得到解药。一日(rì )，新(xīn )一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落(luò )，被小兰撞见的新(xīn )一情急之下编(biān )造(zào )了(le )自己名叫江(jiāng )户川柯南，随后柯南寄居在了小兰(lán )家。小(xiǎo )兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可(kě )以(yǐ )籍着和他一起四出办案一起追查黑夜(yè )人的下落。柯(kē )南在小学认识步美等小学生，他们一(yī )起组织了一个少(shǎo )年侦探团，向罪犯宣战！