工藤新一是(shì )全国著名的高(gāo )中生侦(zhēn )探(tàn )，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员(yuán )发现，击(jī )晕后(hòu )喂了神奇的药水，工(gōng )藤(téng )新一变回(huí )了小孩！新(xīn )一找到了经常帮助他的阿笠(lì )博(bó )士(shì )，博士为(wéi )他度身打造不(bú )少间谍武(wǔ )器。为(wéi )了防止犯(fàn )罪团(tuán )伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一(yī )日，新一 的女友(yǒu )毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友(yǒu )的(de )下(xià )落，被小兰撞见的新一情急之下(xià )编造了自己名叫江(jiāng )户川(chuān )柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利(lì )小五郎是一名私家侦探，新一(yī )可以籍着和他一起四出办案一起(qǐ )追查黑夜人的(de )下(xià )落(luò )。柯南在(zài )小学认识步美等小(xiǎo )学生，他(tā )们一起组织了一个少年侦探团，向(xiàng )罪犯宣战！