工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯(fàn )罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕(yūn )后喂了神(shén )奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到(dào )了经常(cháng )帮助他的阿笠博士(shì )，博士为他度身打造不少间谍武器。为(wéi )了防(fáng )止(zhǐ )犯罪(zuì )团(tuán )伙(huǒ )对他进(jìn )行报复，新一决(jué )定隐姓埋名(míng )，暗(àn )中追(zhuī )查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰(lán )来到了阿笠博士的家寻(xún )找男友的下落，被小(xiǎo )兰撞见的新一(yī )情急之下编造了(le )自己名叫江户川柯南，随后柯南寄(jì )居(jū )在了小兰家。小兰(lán )的父亲毛利小(xiǎo )五(wǔ )郎是一名私家侦探，新一可以籍着(zhe )和他(tā )一起四出办(bàn )案一起追查(chá )黑夜人的下落。柯南在小学认识(shí )步美等小学生，他(tā )们(men )一(yī )起组织了一个(gè )少年侦探团(tuán )，向(xiàng )罪犯宣战(zhàn )！