工藤新一(yī )是全国著名的高中(zhōng )生(shēng )侦(zhēn )探，在一次追查黑衣人犯罪(zuì )团伙时不幸被团(tuán )伙成(chéng )员(yuán )发现，击晕后喂(wèi )了神奇的药水，工藤新(xīn )一变回了小孩(hái )！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博(bó )士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对(duì )他进行(háng )报复(fù )，新一决定隐姓埋(mái )名，暗中追查他们(men )，希望能得到解药。一日，新一(yī ) 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一(yī )情(qíng )急(jí )之下编造了自己名(míng )叫江(jiāng )户川(chuān )柯南(nán )，随后柯南寄(jì )居在了小兰家(jiā )。小兰的父亲毛利小五郎(láng )是一名私(sī )家侦探，新一可(kě )以籍着和他一起四出办案一起(qǐ )追查黑(hēi )夜人的下落。柯南(nán )在小学认识步美(měi )等小(xiǎo )学生，他们一起组织了(le )一(yī )个少年侦(zhēn )探团(tuán )，向罪犯宣战！