工(gōng )藤新一(yī )是全国著名的高中生侦(zhēn )探，在一(yī )次追查黑衣人(rén )犯罪团伙时不幸被团伙成(chéng )员(yuán )发现，击晕(yūn )后喂(wèi )了神奇的药水，工藤新一变回了小孩(hái )！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造(zào )不(bú )少(shǎo )间谍武(wǔ )器。为了防止犯罪团伙(huǒ )对他进行报复，新(xīn )一(yī )决定隐姓埋名，暗中追(zhuī )查他们，希望能得到解药(yào )。一日，新一(yī ) 的女(nǚ )友毛利兰(lán )来到(dào )了阿笠(lì )博士(shì )的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之(zhī )下编造了自己名(míng )叫江户(hù )川(chuān )柯南(nán )，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲(qīn )毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍(jí )着和他一起(qǐ )四出办案一起追查(chá )黑夜人(rén )的下落(luò )。柯南在小学认识步美等小学生，他们(men )一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！