工藤新一是全国著名的高中生侦(zhēn )探，在一次追查黑衣人犯罪(zuì )团伙(huǒ )时不幸被团伙成员发现(xiàn )，击(jī )晕后(hòu )喂了神(shén )奇的药水，工藤新(xīn )一变回了小孩(hái )！新一找到(dào )了经常帮(bāng )助他(tā )的阿笠博士，博士为他度身打造不少(shǎo )间谍武(wǔ )器。为了防止犯(fàn )罪团伙对(duì )他进行报复，新一决定(dìng )隐姓埋名，暗中追查(chá )他们，希(xī )望能得(dé )到解药(yào )。一日，新一 的(de )女友毛利兰来到了阿笠博士的家(jiā )寻找男友的(de )下落，被小兰撞见(jiàn )的新(xīn )一情急之下编(biān )造了自己名叫江户川(chuān )柯南，随后柯南寄居在了(le )小(xiǎo )兰家。小兰的父(fù )亲毛利小五郎是一名私(sī )家(jiā )侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起(qǐ )追(zhuī )查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了(le )一个少年侦探团(tuán )，向罪犯宣战！