工藤新一是全国著名的高中(zhōng )生(shēng )侦探，在一(yī )次追查(chá )黑衣人犯罪团(tuán )伙时不幸被团伙成员发现，击晕后(hòu )喂了(le )神奇的药水，工(gōng )藤新一变回了小孩！新一找到了(le )经常(cháng )帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少(shǎo )间谍武器。为了防止犯罪团伙对他(tā )进行(háng )报复，新一决定(dìng )隐姓埋名，暗(àn )中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰(lán )来到了阿(ā )笠博士的家(jiā )寻找男友(yǒu )的下落，被小(xiǎo )兰撞见的新(xīn )一情急之下编造了自己名(míng )叫(jiào )江户川(chuān )柯南，随后柯南寄居(jū )在了(le )小兰家。小兰(lán )的父亲毛利(lì )小(xiǎo )五郎是一(yī )名私家侦探，新一(yī )可以籍着和他一起(qǐ )四出(chū )办案一起追查黑夜(yè )人的下落。柯南在(zài )小学认识步美等小学生，他(tā )们一(yī )起组(zǔ )织了一个少年侦探团，向罪(zuì )犯宣战！