工藤新一是(shì )全国著名的高中生侦探，在一次追查(chá )黑衣人犯罪团伙(huǒ )时不幸被团伙成员发(fā )现，击(jī )晕后喂了神奇的(de )药水(shuǐ )，工藤新一变回了小孩(hái )！新一找到了经常帮(bāng )助他的阿笠博(bó )士(shì )，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯(fàn )罪团伙对他进行报(bào )复(fù )，新一决定隐姓埋名，暗(àn )中追(zhuī )查(chá )他们(men )，希望能得到(dào )解药。一日，新一 的(de )女友毛利兰(lán )来到了阿笠博(bó )士的家(jiā )寻找男友的下落(luò )，被小兰撞见(jiàn )的新一情急之下(xià )编(biān )造了自(zì )己名叫(jiào )江户川柯南，随(suí )后(hòu )柯南寄(jì )居在了小兰家。小兰(lán )的父亲毛(máo )利小五郎是一名私家侦(zhēn )探，新一可以籍着和他一起四出办案一(yī )起追查黑夜人的下落。柯南在小学(xué )认识步美等小学(xué )生，他们一(yī )起组织了一个少年侦探团，向(xiàng )罪犯宣战！