工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次(cì )追查(chá )黑(hēi )衣(yī )人犯罪(zuì )团伙时不幸被团伙成员(yuán )发现，击(jī )晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩(hái )！新一找到了经常帮(bāng )助(zhù )他的阿笠博士，博士为(wéi )他度身打造不少间谍武器(qì )。为了防止犯罪(zuì )团伙对他进行报复，新(xīn )一决定(dìng )隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得(dé )到解药。一日，新一 的女友毛利(lì )兰(lán )来(lái )到了(le )阿笠博(bó )士的家寻找男友的下落，被小兰(lán )撞见的新一情急之下编造了自己名叫江(jiāng )户川(chuān )柯南，随后柯南寄居在(zài )了小兰家。小(xiǎo )兰的父(fù )亲毛(máo )利小五郎是(shì )一(yī )名私家侦探，新一可以籍(jí )着和他一起四(sì )出办案一起追查黑夜人的下落(luò )。柯南在小学(xué )认识(shí )步美等小学生，他们一起组织(zhī )了一个少(shǎo )年侦(zhēn )探团，向罪犯宣战！