工藤新一是全国著名的高(gāo )中生侦探，在一次追查(chá )黑衣人犯罪团伙时(shí )不幸被团伙成员(yuán )发现(xiàn )，击晕后(hòu )喂了神奇的药水，工藤新一变回了(le )小孩！新一找到了(le )经常帮助他的阿(ā )笠博士，博士(shì )为他度身打造不少间谍武器。为了(le )防止犯罪团伙对(duì )他进行报复，新一决定隐姓埋(mái )名(míng )，暗中追查他(tā )们，希望能得(dé )到解药(yào )。一日，新一 的女友毛利兰来(lái )到了阿笠(lì )博士的(de )家寻找男友的下落，被小(xiǎo )兰撞见的新一情急之(zhī )下编造(zào )了(le )自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了(le )小兰家。小(xiǎo )兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦(zhēn )探，新一可(kě )以(yǐ )籍着和他一起四出办案一(yī )起追(zhuī )查(chá )黑夜人的下落。柯南(nán )在小学认(rèn )识步美等小学生，他们一(yī )起(qǐ )组织了一个少年侦探团(tuán )，向(xiàng )罪(zuì )犯宣战！