工藤(téng )新(xīn )一是全国著(zhe )名的高中生侦探，在一次追(zhuī )查黑衣(yī )人犯(fàn )罪团伙时不幸被团伙成员发现(xiàn )，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回(huí )了小孩！新(xīn )一找到(dào )了经常(cháng )帮助他的阿笠博(bó )士，博士为他(tā )度身打造不(bú )少间谍武器。为(wéi )了防止犯罪团(tuán )伙对他进(jìn )行报复，新一决定隐姓埋名，暗中(zhōng )追(zhuī )查他们，希望能得到解(jiě )药(yào )。一(yī )日，新一 的(de )女友毛利兰(lán )来到了阿(ā )笠博士的家寻找男(nán )友的下(xià )落，被小兰撞见(jiàn )的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后(hòu )柯(kē )南(nán )寄居在了小兰家。小兰的父亲(qīn )毛利小五郎是一名(míng )私家侦探，新一可以籍(jí )着和他一(yī )起四出办案一起追查黑(hēi )夜人(rén )的下落。柯南在小学认识步美(měi )等小学生，他们一起组织(zhī )了一(yī )个少年侦探团，向罪犯宣战！