工藤新一是全国著名(míng )的高(gāo )中生侦探，在一次追查(chá )黑衣(yī )人犯罪团伙(huǒ )时不幸(xìng )被团伙(huǒ )成员发现，击晕后(hòu )喂了神奇的药水，工藤新一变回了(le )小孩！新(xīn )一找到(dào )了经常帮助他的阿笠(lì )博士(shì )，博士为他度身打造不少(shǎo )间(jiān )谍武器(qì )。为了防止犯罪团伙对他进行报复(fù )，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到(dào )解药。一日，新一 的女(nǚ )友毛利兰来到了阿笠博士的(de )家寻(xún )找男友的下落，被(bèi )小兰(lán )撞(zhuàng )见的新一情急之下编(biān )造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄(jì )居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一(yī )可(kě )以(yǐ )籍着和他一起四出(chū )办案一(yī )起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美(měi )等(děng )小学生，他们一(yī )起组织了一个(gè )少年侦探团，向罪犯(fàn )宣战！