工藤(téng )新一是全国(guó )著名的高(gāo )中生侦探，在一(yī )次追查黑衣人犯罪团伙(huǒ )时不幸被团伙成(chéng )员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变(biàn )回了(le )小孩！新一找到(dào )了(le )经常帮助他的(de )阿笠博士，博士为他度身打造不少间(jiān )谍武器。为了防止(zhǐ )犯罪团伙对他进行报复，新一决(jué )定隐(yǐn )姓埋名，暗(àn )中追查他们，希望能得到解(jiě )药。一日，新一 的(de )女友毛利兰来到了阿笠博士的(de )家(jiā )寻找男友的下落，被(bèi )小兰(lán )撞见的新一情急之下编造了自(zì )己名叫江(jiāng )户川(chuān )柯南，随后柯南寄(jì )居(jū )在(zài )了小兰家。小兰的父(fù )亲毛(máo )利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一(yī )起四出(chū )办(bàn )案一起追查黑夜人的下(xià )落。柯南在小学(xué )认识(shí )步美等小学生，他们一起组织(zhī )了(le )一个少年侦探团，向罪犯宣战！