工藤新(xīn )一是全(quán )国著名的高中生侦探，在(zài )一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙(huǒ )成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常(cháng )帮助他(tā )的(de )阿笠博士，博(bó )士为他度身打(dǎ )造不少间谍(dié )武器。为了防止犯(fàn )罪团伙对他(tā )进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查(chá )他(tā )们，希望能得到解药。一日，新一 的女(nǚ )友(yǒu )毛利兰来到了阿笠博士(shì )的家寻找男友的下(xià )落，被小兰撞见的新一情急之(zhī )下编造了自己名叫江(jiāng )户川柯南，随后(hòu )柯(kē )南寄居在(zài )了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎(láng )是一名(míng )私家侦探(tàn )，新一可以籍着和(hé )他一起四出办案一(yī )起追查黑夜人的(de )下落(luò )。柯南(nán )在小学(xué )认识(shí )步美等小学生，他们(men )一起组织了一个少(shǎo )年(nián )侦(zhēn )探团，向罪犯(fàn )宣战！