工藤新一是全(quán )国著名的(de )高中(zhōng )生侦探，在一次追(zhuī )查(chá )黑衣人犯罪团伙(huǒ )时不(bú )幸被团伙成员发现(xiàn )，击晕后喂了神(shén )奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经(jīng )常帮(bāng )助他(tā )的阿笠博士，博士为他度身打造不少间(jiān )谍武(wǔ )器。为了防止犯(fàn )罪团伙对他进行(háng )报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查(chá )他们，希(xī )望能得(dé )到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士(shì )的家寻找男(nán )友(yǒu )的下落，被小兰撞见的(de )新一情急之下编造(zào )了自(zì )己名叫(jiào )江户川柯南(nán )，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲(qīn )毛利小五郎是一(yī )名(míng )私(sī )家侦探，新一可以籍着和他(tā )一起四出办案(àn )一起追查(chá )黑夜人的下落(luò )。柯南在小(xiǎo )学认(rèn )识步美等小学生，他们一起组织了一个(gè )少年侦探团，向(xiàng )罪犯宣战(zhàn )！