工藤新(xīn )一是全国著名的高中生(shēng )侦探，在一次追(zhuī )查黑衣人犯罪团伙时不幸(xìng )被团伙(huǒ )成员发现(xiàn )，击(jī )晕后喂了神(shén )奇的药水，工藤新一(yī )变回了小孩！新(xīn )一找(zhǎo )到了经常帮助他的阿笠博士，博士为(wéi )他度(dù )身打造不少间谍武器。为(wéi )了防止犯罪团伙对他进行报(bào )复，新(xīn )一决(jué )定隐姓埋(mái )名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日(rì )，新(xīn )一 的女友毛利兰来到了阿(ā )笠博士(shì )的(de )家寻(xún )找男友的下落，被小兰撞见的新一情急(jí )之(zhī )下编造(zào )了自己(jǐ )名叫江户川柯南，随后柯南寄居在(zài )了小兰家。小(xiǎo )兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一(yī )可以(yǐ )籍着和他一起四出(chū )办案一起追查黑夜(yè )人的下落(luò )。柯南在小学认识步美(měi )等小(xiǎo )学生(shēng )，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯(fàn )宣战！