工藤新一是(shì )全国著名的高中生侦(zhēn )探，在(zài )一次追(zhuī )查黑衣人犯(fàn )罪团伙时不幸(xìng )被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常(cháng )帮助(zhù )他的阿笠博士，博(bó )士(shì )为他度身打造不少(shǎo )间(jiān )谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定(dìng )隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解(jiě )药。一日，新一 的女友毛(máo )利(lì )兰来到了阿(ā )笠博士的(de )家(jiā )寻(xún )找男友的(de )下落，被小兰(lán )撞见的新(xīn )一情急之下编造了(le )自己(jǐ )名叫江户川柯南(nán )，随后柯南寄居在了小兰家。小(xiǎo )兰的父亲毛利(lì )小五郎是一名私家侦(zhēn )探，新一可以籍着和他(tā )一(yī )起四出办(bàn )案一起追(zhuī )查黑夜人的(de )下落。柯南在小(xiǎo )学认识步美等小(xiǎo )学生，他们一起组(zǔ )织(zhī )了(le )一个少年侦探团，向罪犯宣战！