工藤新一是全国著名的高(gāo )中生侦探，在一次追查(chá )黑衣人犯(fàn )罪(zuì )团伙时(shí )不幸被团伙成员发(fā )现，击晕后喂(wèi )了神奇的药水，工藤新一变回了小(xiǎo )孩！新一找(zhǎo )到了经常帮助他的阿笠(lì )博(bó )士(shì )，博士为他度身打造不少间谍武器。为(wéi )了防止犯罪团伙对(duì )他进行报复，新一决定(dìng )隐姓埋名(míng )，暗中追查(chá )他(tā )们，希望能得到解药。一日(rì )，新(xīn )一 的女(nǚ )友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞(zhuàng )见的新一情(qíng )急之下编造了自己名(míng )叫(jiào )江(jiāng )户川柯(kē )南，随后柯(kē )南寄(jì )居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家(jiā )侦探，新(xīn )一可(kě )以籍着(zhe )和他(tā )一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南(nán )在(zài )小学认识步美等(děng )小学生，他们一起组(zǔ )织了一个少年侦探(tàn )团，向罪犯宣战！