工藤(téng )新一是全国(guó )著名的高(gāo )中(zhōng )生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙(huǒ )时不幸被团伙成员发现(xiàn )，击(jī )晕后喂了(le )神奇(qí )的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造(zào )不(bú )少间谍武(wǔ )器。为了防止(zhǐ )犯罪团伙对他(tā )进行报(bào )复(fù )，新(xīn )一决(jué )定隐姓埋名，暗中追查他们(men )，希望能得到解药。一日(rì )，新一(yī ) 的女友毛利兰来到了阿笠博士的(de )家寻找男友的(de )下落，被小兰撞见的(de )新(xīn )一情急之下编造了自己名叫江(jiāng )户川柯南，随后(hòu )柯南寄(jì )居在了小兰(lán )家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探(tàn )，新一可以籍着和他一起(qǐ )四(sì )出办案一起追查黑夜人的下(xià )落。柯(kē )南在小学认识步美等小(xiǎo )学生，他们一起(qǐ )组织了一(yī )个少年侦探团，向罪犯(fàn )宣战！