工藤新一(yī )是全国著名的高中生侦探，在一次(cì )追查(chá )黑衣人犯罪团伙时不幸被团(tuán )伙成员发(fā )现，击晕后喂了(le )神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造(zào )不少间谍武(wǔ )器。为了防(fáng )止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐(yǐn )姓埋名，暗中追查他们(men )，希望能得到解药。一(yī )日，新一 的女友毛利(lì )兰来到了阿笠博士的家寻找男友(yǒu )的下落，被小兰撞见(jiàn )的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯(kē )南，随后柯南寄(jì )居在了(le )小兰家。小兰的父(fù )亲毛利小五郎是(shì )一名私家侦(zhēn )探，新(xīn )一可(kě )以(yǐ )籍着和他一起四(sì )出办案一(yī )起追查黑夜人的(de )下落。柯(kē )南在小学认识(shí )步(bù )美(měi )等小学生，他(tā )们一起组织了一个少年(nián )侦探(tàn )团，向罪犯宣(xuān )战！