工藤新一是全国著名(míng )的高中生侦探，在一(yī )次追(zhuī )查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击(jī )晕后喂(wèi )了神奇的药水，工藤(téng )新(xīn )一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士(shì )，博士为他度(dù )身打造不少(shǎo )间谍武器。为了防止犯罪团(tuán )伙对他(tā )进行报复，新一(yī )决定隐姓埋(mái )名，暗中追查他们，希望(wàng )能(néng )得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博(bó )士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编(biān )造了自己名叫江户川柯南，随(suí )后柯南寄(jì )居(jū )在了小兰家(jiā )。小兰的(de )父亲毛利小(xiǎo )五(wǔ )郎是一名私(sī )家侦探(tàn )，新一可以籍着和(hé )他一起四出办(bàn )案(àn )一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步(bù )美等小学(xué )生，他们(men )一起组(zǔ )织了一个少年侦探团，向罪(zuì )犯宣战！