工藤新一是全国著(zhe )名的高中生(shēng )侦(zhēn )探，在一次追查黑衣人犯罪(zuì )团(tuán )伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新(xīn )一变(biàn )回了小孩！新一找(zhǎo )到(dào )了经常帮助他的阿笠博士，博(bó )士为他度身打(dǎ )造不少间谍(dié )武(wǔ )器。为了防止犯罪团(tuán )伙对他(tā )进行报复，新一决定(dìng )隐姓埋名，暗中追查他(tā )们，希望(wàng )能得到解药(yào )。一(yī )日，新一 的女友(yǒu )毛利兰来到了阿(ā )笠博士(shì )的家寻找(zhǎo )男友的下落，被小兰撞见的新一(yī )情急之(zhī )下(xià )编造(zào )了自己名叫江户川柯南(nán )，随(suí )后柯南寄居在了(le )小兰家。小兰(lán )的父亲毛利小五郎(láng )是一(yī )名私家侦探，新一可以籍着和他一起四(sì )出办案一起追查(chá )黑夜人的下(xià )落。柯南(nán )在小学(xué )认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！