工藤新一是全国著名的高中生侦探，在(zài )一次追查(chá )黑衣人(rén )犯罪团伙时不(bú )幸被团(tuán )伙(huǒ )成员发现，击晕(yūn )后喂了神奇(qí )的药水，工藤新一变回(huí )了小孩！新一找到了经常(cháng )帮助他(tā )的阿笠博士，博士(shì )为他度(dù )身打(dǎ )造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对(duì )他(tā )进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药(yào )。一日，新一(yī ) 的女(nǚ )友毛利兰来到了阿(ā )笠博(bó )士的家寻找男友(yǒu )的(de )下落，被小兰撞(zhuàng )见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随(suí )后柯南(nán )寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家(jiā )侦探，新一可以籍(jí )着(zhe )和他一起四(sì )出办案一起追查黑夜(yè )人的下(xià )落。柯(kē )南(nán )在小学认识步美等(děng )小学(xué )生，他们一起组织(zhī )了一个少年(nián )侦探团(tuán )，向罪犯宣战！