工(gōng )藤新一(yī )是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团(tuán )伙时不(bú )幸被团伙(huǒ )成员发现，击晕后喂(wèi )了神奇的药水，工藤新一变回了(le )小孩！新一(yī )找(zhǎo )到了经常帮助他的(de )阿(ā )笠博士，博士为他度身打造不(bú )少间谍武器。为(wéi )了防止犯(fàn )罪团伙对他(tā )进行报(bào )复，新一(yī )决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望(wàng )能得(dé )到解药。一日(rì )，新(xīn )一 的女友毛利兰来到(dào )了阿笠博士的(de )家寻找男友(yǒu )的下落，被小(xiǎo )兰(lán )撞见的新一情(qíng )急(jí )之下(xià )编(biān )造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在(zài )了小兰家。小兰的父亲毛利小(xiǎo )五郎是一(yī )名私家侦探，新一可以籍(jí )着和他一起四出办案一起追查黑夜(yè )人的下(xià )落。柯南(nán )在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦(zhēn )探团，向罪犯宣战！