工藤新一是全国著(zhe )名(míng )的高中生侦探，在一次(cì )追查黑衣人犯罪团伙时不幸被(bèi )团伙成员(yuán )发现，击晕后喂(wèi )了神(shén )奇的药水，工藤新一变回(huí )了小孩！新一找到了(le )经常帮助他的阿笠博士(shì )，博士为他(tā )度身打造不少间谍武器(qì )。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓(xìng )埋名(míng )，暗中追查(chá )他们，希望能(néng )得到解药。一日，新一 的女友毛利兰(lán )来(lái )到了阿笠博士的家寻找男(nán )友(yǒu )的(de )下落，被小兰撞见的新(xīn )一情急(jí )之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南(nán )寄居在了小兰家。小兰的父亲毛(máo )利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍(jí )着(zhe )和他一起四出办案(àn )一起(qǐ )追查黑夜人的下(xià )落。柯(kē )南在(zài )小学认识步美等(děng )小学(xué )生，他们(men )一起(qǐ )组织了一个少年侦探(tàn )团，向罪犯宣(xuān )战！