工(gōng )藤新一是全国著名的高中生侦探(tàn )，在一次追查黑衣人犯罪团伙(huǒ )时不幸被(bèi )团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一(yī )变(biàn )回了小孩！新(xīn )一找(zhǎo )到了经常帮助他的阿笠博士，博士(shì )为他度身打(dǎ )造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报(bào )复，新(xīn )一决定隐姓埋名，暗中追查他们(men )，希望能得到解药。一(yī )日，新一 的女友(yǒu )毛利兰来(lái )到了阿(ā )笠博士的(de )家寻(xún )找男(nán )友的下(xià )落，被小(xiǎo )兰撞见(jiàn )的(de )新一(yī )情急之下编造了自己(jǐ )名叫江(jiāng )户川柯南，随后柯南(nán )寄居在了小兰家(jiā )。小兰的(de )父亲毛(máo )利小五郎是一名私家侦探，新(xīn )一可以籍着和他一起四出办案一(yī )起追查黑(hēi )夜人的下落。柯南在小学认识(shí )步美等(děng )小学(xué )生(shēng )，他们一起组织(zhī )了一个少年侦探团，向罪犯宣战！