工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不(bú )幸被团伙成(chéng )员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新(xīn )一(yī )变回了小孩！新一找(zhǎo )到(dào )了经常帮(bāng )助他的阿笠博士，博士为他度身打(dǎ )造不少间(jiān )谍(dié )武器。为了(le )防止犯罪团(tuán )伙对(duì )他进行报复，新一决定(dìng )隐(yǐn )姓埋名，暗中追查(chá )他们，希望(wàng )能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来(lái )到了阿笠博(bó )士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急(jí )之下编造了自己名叫(jiào )江(jiāng )户川柯南(nán )，随后(hòu )柯南寄居在了小兰(lán )家。小兰的父亲毛利小(xiǎo )五郎是一(yī )名(míng )私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下(xià )落。柯南在(zài )小(xiǎo )学认识步美等小学生，他们(men )一(yī )起组织(zhī )了一个少年侦探团(tuán )，向罪犯(fàn )宣战！