工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员(yuán )发现，击晕后喂(wèi )了神奇的药水，工藤新一变回了小(xiǎo )孩！新一找到了经常帮助他的阿(ā )笠(lì )博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为(wéi )了防止犯罪团伙对(duì )他进行报复，新一决定隐姓(xìng )埋(mái )名，暗中(zhōng )追查他们，希望能得到(dào )解药。一日，新一 的女友毛(máo )利兰来(lái )到了阿笠博士的家(jiā )寻找男友的下落，被小(xiǎo )兰(lán )撞见的新一情急之下编(biān )造了自(zì )己(jǐ )名(míng )叫江(jiāng )户(hù )川柯(kē )南(nán )，随后柯(kē )南(nán )寄居在了小兰家。小兰的(de )父亲毛利(lì )小五(wǔ )郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起(qǐ )四出办(bàn )案一起追查黑夜人的下(xià )落(luò )。柯南在(zài )小学(xué )认识步美等小学生，他们一(yī )起组织了(le )一个少年侦探团，向罪犯宣(xuān )战！