工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪(zuì )团伙时不幸被团伙成员(yuán )发现，击晕(yūn )后喂(wèi )了神奇的药水，工(gōng )藤新一变回了小孩！新一找(zhǎo )到(dào )了(le )经常帮助他的阿笠博(bó )士，博士为(wéi )他度身打造不少间谍武(wǔ )器。为了防止(zhǐ )犯罪团伙(huǒ )对他进行报复，新一决(jué )定隐姓埋名，暗中追查他们，希(xī )望能得(dé )到(dào )解药。一日，新(xīn )一 的女友毛利兰来到了阿笠(lì )博士的家寻找(zhǎo )男友的下落，被小兰撞见的新一情(qíng )急(jí )之下编造(zào )了自己名叫江户川柯南，随后(hòu )柯(kē )南(nán )寄居在了小兰家。小(xiǎo )兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一(yī )可以籍着和他(tā )一起四出办案一起追(zhuī )查黑夜人(rén )的下(xià )落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起(qǐ )组(zǔ )织(zhī )了一个少年侦探团，向罪犯(fàn )宣战(zhàn )！