工藤新一是全国著名的高中(zhōng )生侦探，在(zài )一次追查黑衣人犯(fàn )罪团伙时不幸被团伙成员发现(xiàn )，击晕后喂了神(shén )奇的药(yào )水(shuǐ )，工藤新一(yī )变回了(le )小孩！新一找到了经常帮助他(tā )的(de )阿笠博士(shì )，博士为(wéi )他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一(yī )决定隐姓(xìng )埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛(máo )利兰来(lái )到了阿笠(lì )博士的家寻找男(nán )友的(de )下落，被小兰撞见(jiàn )的(de )新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯(kē )南寄居在(zài )了小兰家。小(xiǎo )兰的(de )父亲(qīn )毛利小五郎是一名私家侦探，新一可(kě )以籍着(zhe )和他一起四(sì )出(chū )办案一起追查黑夜人的下落。柯南在(zài )小(xiǎo )学认识步美(měi )等小学(xué )生，他们(men )一起组织(zhī )了一个少(shǎo )年侦探(tàn )团，向罪犯宣战！