工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣(yī )人犯罪(zuì )团伙时不幸被团伙成员发(fā )现，击晕后(hòu )喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新(xīn )一找到了经常(cháng )帮助他的阿笠博(bó )士，博士为他(tā )度身(shēn )打造不少间(jiān )谍武(wǔ )器。为了防止犯罪团伙(huǒ )对他进(jìn )行(háng )报复，新一(yī )决定隐姓埋名(míng )，暗中(zhōng )追查他(tā )们，希望能得到解药。一日，新一(yī ) 的女友毛利兰来到了阿笠(lì )博士的家寻找男(nán )友的下落，被(bèi )小兰撞(zhuàng )见的新一情急之下编造了自己(jǐ )名叫江户(hù )川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛(máo )利小五郎是一名私家侦探，新一(yī )可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落(luò )。柯南在小(xiǎo )学认识步美等(děng )小(xiǎo )学生，他们一起组(zǔ )织(zhī )了一个少年侦(zhēn )探团，向(xiàng )罪犯宣战(zhàn )！